Mario Botta родился 1 апреля 1943 года в Мендризио, Тичино. По завершении стажировки в Лугано он поступил в Миланский колледж искусств, после чего учился в Университете архитектуры в Венеции под руководством Carlo Scarpa и Giuseppe Mazzariol. В ходе обучения он имел возможность общаться и работать с Le Corbusier и Louis I. Kahn.

Окончив университет в 1969 году, в 1970-м Mario вернулся в Лугано и приступил к работе. Он также занимался активной преподавательской деятельностью — читал лекции и курсы, проводил семинары в различных архитектурных школах по всей Европе, в Азии, США и странах Латинской Америки. В 1976 году Mario Botta работал внештатным преподавателем в Лозаннском политехническом институте, а в 1987-м читал лекции в Йельской школе архитектуры в Нью-Хейвене. В 1983 году он был назначен профессором Швейцарской политехнической школы. С 1982 по 1987 годы Mario Botta являлся членом Швейцарской федеральной комиссии изобразительных искусств.

Начав с разработки проектов индивидуальных жилых домов в Тичино, Mario переключился на создание различных видов общественных зданий, таких как школы, банки, административные здания, библиотеки, музеи и культовые сооружения.

Среди самых известных работ Botta — Музей современного искусства в Сан-Франциско (США), храм Воскресения в Эври (Франция), музей Тэнгли в Базеле (Швейцария), синагога Цимбалиста и Центр еврейского наследия в Тель-Авиве (Израиль), Центральная библиотека города Дортмунда (Германия), Музей современного искусства Тренто и Роверето (MART) в Роверето (Италия), Башня Киобо и Лееум и Музей искусства компании Samsung в Сеуле (Южная Корея), Консультационный центр Тата в Нью-Дели и Хайдарабаде (Индия), церковь Папы Джованни XXIII в Сериате (Италия), реставрация театра Ла Скала в Милане (Италия), церковь Санто-Вольто в Турине (Италия), спа-центр Tschuggen Bergoase в Арозе (Швейцария), Музей современного искусства Бехтлер в Шарлотте (США), штаб-квартира и жилой комплекс Campari в Сесто-Сан-Джованни (Италия), библиотека и музей искусств Университета Цинхуа в Пекине (Китай), городское планирование района Ex Appiani в Тревизо (Италия), гостиница Twelve at Hengshan в Шанхае (Китай), а также недавно открывшийся ресторан Fiore di Pietra в Монте-Дженерозо (Швейцария).

Его работы, представленные на многочисленных выставках, получили признание во всем мире. Mario Botta является почетным членом многих культурных учреждений и лауреатом почетных степеней в различных университетах Аргентины, Греции, Румынии, Болгарии, Бразилии и Швейцарии.

В 1996 году Botta основал Академию архитектуры в Мендризио, где продолжает вести преподавательскую деятельность и где в 2002–2003 и 2011–2013 годах занимал должность декана.

Посвятив себя защите архитектурного наследия, Botta создал в Мендризио (Швейцария) театр архитектуры Teatro dell’Architeturra, который открыл свои двери для зрителей в 2018 году.